8月13日15时左右，上海中心气象台工作人员在本市雷达回波图上清楚地看到，长江口区正有明显的降水回波，并向浦东东北部发展。这个在长江口区局地“酿造”的强雷暴云团牢牢盘踞浦东东北部地区，不肯挪动一步。为此，浦东东北部15时许遭遇罕见的狂风暴雨的猛烈“肆虐”，时间长达一个多小时。
频发的强对流天气再度连连触响本市灾害性天气预警。上海中心气象台于12时06分拉响雷电黄色预警，15时10分又拉响暴雨黄色和大风黄色预警，市防汛指挥部也于15时20分发布防汛防台蓝色预警。
“祸不单行”，就在浦东遭遇强雷暴云团的同时，从太湖流域自西向东迅速移动的一个“外来”雷暴云团也在逐步逼近本市。为此，16时07分气象台将暴雨黄色预警又紧急升级为暴雨橙色预警。市防汛指挥部也于16时10分将防汛防台蓝色预警升级为黄色预警，并启动三级应急响应。
接近18时的时候，从苏南地区压下来的又一个雷暴云团再度开始影响本市，申城局部地区再度降水，不过该雷暴云团已渐成“强弩之末”，对本市影响并不大。
据市防汛办统计，截至20时，在全市测得雨量的257个测站点中，浦东北部4个测站和崇明南门1个测站的雨量超100毫米，雨量最大的为浦东王港179毫米，其中15时10分至16时10分一小时雨量就达140.2毫米，超过了百年一遇（100.82毫米/小时）的标准。浦东、崇明、长宁还有7个测站雨量超过50毫米的暴雨标准。
浦东曹路镇14时55分至15时10分还下了蚕豆大小的冰雹并出现11级大风。
由于遭遇超百年一遇大暴雨，浦东曹路、蔡路、龚路以及崇明等地共计30多条段道路和15个居民小区曾一度短时积水。该地区的长江隧桥浦东入口也自开通以来首次出现雨水倒灌情况，隧道内积水最深处达20厘米。为此相关部门从15时32分起一度关闭长兴往市区方向车道，经上海市排水公司动用远距离应急排水抢险泵车进行抢排，终于于16时50分恢复正常通行，其间未发生车损及人员伤亡事故。
雨情发生后，全市防汛系统紧急动员，各排水泵站全部转入暴雨模式运行，各水闸也趁潮退排水降低内河水位，1000多名工作人员上街巡视、排水。截至20时积水已基本排除。 | 
